Lượng nước Hồ Kẻ Gỗ còn hơn 45 triệu m3 trên tổng sức chứa 345 triệu m3. Mực nước xuống thấp khiến lòng hồ cạn trơ đáy, ảnh hưởng lớn hoạt động tưới tiêu cho vùng hạ du.